🧬 CrossDesign

可视化果蝇基因型编辑与杂交方案设计工具

🎯 选择实验目的
🧬 添加亲本
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尚未添加亲本,请输入基因型后点击「添加亲本」
📋 杂交流程图
🧬 品系库

添加品系到库中,用于杂交模拟。格式:(cn,cn)(+/CyO)(+/TM3, Sb)
测试/模拟杂交时,请统一用 Tg / Tg1 / Tg2 表示转基因名,避免使用 A、B 等易冲突代号。

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每行一个品系,格式:名称,基因型 或仅基因型

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品系库为空,请添加品系
📖 使用说明

🚀 快速开始

遗传设计工具帮助您可视化编辑果蝇基因型、模拟杂交过程、自动生成杂交方案。支持从 Excel 直接粘贴基因型数据。

🧬 基因型格式规范

基因型使用圆括号包裹每条染色体,逗号分隔同源染色体:

(cn,cn)(+/CyO)(+/TM3, Sb)
  • 每个 () 代表一条染色体(顺序:X → 2 → 3 → 4)
  • 括号内逗号分隔同源染色体(左侧=A,右侧=B)
  • 同一染色体上的多个基因用逗号+空格分隔(如 TM3, Sb),不要仅用空格分隔
  • + 表示野生型等位基因

省略规则:若某条染色体为野生型(+/+),系统会自动省略该染色体,使基因型更简洁。1号染色体(X)默认即为野生型,雄性野生型 X/Y 同样省略。性别信息通过品系标签(♀/♂)或方案上下文保留。例如 UAS-Tg1/CyO 等价于完整写法 +/+; UAS-Tg1/CyO; +/+; +/+(雌蝇)或 +/Y; UAS-Tg1/CyO; +/+; +/+(雄蝇)。

纯合简写:当某条染色体两条同源臂上基因完全相同时,系统会以单拷贝显示。例如 UAS-Tg1 等价于 UAS-Tg1/UAS-Tg1b-GAL4 等价于 b-GAL4/b-GAL4。若需表示杂合,请使用 /+/CyO 等斜线格式。

测试/模拟命名规则:若仅用于测试或模拟杂交,请统一用 Tg(transgene)表示转基因名,并可用 Tg1、Tg2 等加以区分,例如 UAS-Tg1/CyOUAS-Tg1/GAL4。避免使用 A、B 等单字母代号,以免与现有基因命名体系冲突(如 B 表示 Bar)。

常见示例:

基因型说明
+/+野生型(w1118,省略所有野生型染色体)
UAS-Tg12号染色体 UAS-Tg1 纯合(等价于 UAS-Tg1/UAS-Tg1)
b-GAL43号染色体 b-GAL4 纯合(等价于 b-GAL4/b-GAL4)
b-GAL4/+3号染色体 b-GAL4 杂合(需显式使用 /+)
(w)(+,+)(+,+)白眼雄蝇(括号格式明确只有一条 X,显示 X/Y)
w白眼纯合(简单格式,性别由上下文决定)
(w,w)(+,CyO)(+,+)w/w; +/CyO白眼雌蝇,2号带 CyO 平衡子
(+,+)(cn,cn)(+,+)cn朱红眼纯合突变体(2号,省略野生型 X、3、4)
(+,+)(+,+)(+,TM3, Sb)+/+; +/TM3, Sb3号带 TM3 平衡子(Sb 标记)

📝 来源追踪

如果您想记录每个基因来自哪个原始品系,可以粘贴两行数据:

(cn,cn)(+/CyO)(+/+) (品系A,品系A)(品系B,品系B)(品系B,品系B)

系统会将第二行解析为来源信息,在染色体可视化中标注。

⚗️ 模拟杂交

使用步骤:

  1. 在「品系库」中添加亲本品系
  2. 点击品系卡片上的 ♀ 或 ♂ 图标选择作为母本或父本
  3. 设置是否考虑重组(果蝇雄性不发生重组,默认雌蝇考虑重组)
  4. 点击「推导后代」查看结果

🎯 设计杂交

使用步骤:

  1. 选择实验目的(如「单染色体重组品系」或「单染色体稳定系」)
  2. 选择目标染色体(X、2 号或 3 号;单染色体稳定系通过下拉菜单选择)
  3. 输入亲本的基因型(单染色体稳定系只需 1 个亲本),并选择该亲本性别
  4. 系统根据输入基因型与性别自动判断并生成对应杂交方案

支持的实验目的:

目的说明
单染色体重组品系选择 X、2 号或 3 号染色体,将两个突变连锁到同一条染色体。X 染色体使用 FM7a 平衡子,2 号使用 CyO/Sp,3 号使用 TM6B/TM2
双染色体稳定系选择 1+2 / 1+3 / 2+3 组合,用平衡子维持两条染色体上的突变
单染色体稳定系选择 X、2 号或 3 号染色体,用平衡染色体维持单基因突变。X 染色体使用 FM7a 平衡子,2 号使用 Sp/CyO,3 号使用 TM2/TM6B;方案同时给出平衡维持系和纯合系两条路线。P0 阶段亲本放在其对应性别位

📚 常见突变基因速查

基因表型染色体
w (white)白眼X
y (yellow)黄体X
B (Bar)棒眼X
sn (singed)卷刚毛X
m (miniature)小翅X
cn (cinnabar)朱红眼2
vg (vestigial)残翅2
bw (brown)褐眼2
e (ebony)黑檀体3
CyO卷翅(平衡子)2
FM7a棒眼+黄体+缺刚毛(X平衡子)X
TM3短粗刚毛(平衡子)3
TM6B短粗身体(平衡子)3

💡 注意事项

  • 果蝇雄性不发生重组,重组仅在雌性减数分裂中发生
  • X 染色体半合子雄蝇(X/+)无同源染色体,无法发生重组;FM7a 是 X 染色体专用平衡子,携带棒眼显性标记
  • X 染色体双基因重组需根据目标基因是否致死选择场景:均可纯合则两条独立纯化闭环,纯合致死则仅保留雌系单一闭环
  • 平衡染色体(CyO、TM3、TM6B、FM7a 等)纯合致死,系统自动排除
  • 显示的基因型均为正体,无需斜体
  • 测试/模拟杂交时,请统一用 Tg / Tg1 / Tg2 表示转基因名,避免使用 A、B 等易与内源基因(如 B/Bar)冲突的代号
  • 数据保存在浏览器本地,清除浏览器数据会丢失

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